深圳先进院目前设有计算机科学与技术、生物学、化学、控制科学与工程4个博士后流动站，其中计算机科学与技术博士后科研流动站为深圳市获批的首个该领域博士后科研流动站。自设站以来，流动站已累计招收博士后研究人员2363人，目前在站博士后912人。博士后平均年龄30岁，其中91%来自双一流高校，出站博士后留粤比例80%，留深人数比例75%，为粤港澳大湾区发展提供了人才与智力支持。

为响应地方企业需求，先进院积极探索合作机制，目前与80余家企业建立了联合培养模式，包括比亚迪、富士康、香港大学深圳医院、迈瑞医疗等行业领军企业。截止2023年底，与企业累计联合培养超700人，实现了创新与培养双促进的良性循环。

先进院依托现有博士点、学科及师资优势，近三年累计获批中国博后科学基金122项、国自然基金134项以及博新计划12项，获批项目率高达33%，中国博后科学基金资助人数连续七年领跑全国科研所。